Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRPF3Q9ULD4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRPF3Q9ULD4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms