Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNL1Q9UK58 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms