Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNNA3Q9UI47 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms