Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA4Q9UI42 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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