Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms