Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRP68Q9UHB9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRP68Q9UHB9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms