Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLKQ9UBT6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms