Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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