Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms