Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FBXO28Q9NVF7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO28Q9NVF7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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