Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms