Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CENPMQ9NSP4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms