Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELLSQ9NRZ9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms