Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA4L2Q9NRX3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms