Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSHZ2Q9NRE2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSHZ2Q9NRE2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms