Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD5

PICK1, PRKCA-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICK1Q9NRD5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICK1Q9NRD5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICK1Q9NRD5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms