Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTA1Q9NP79 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms