Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPF2Q9HAU5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms