Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED28Q9H204 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms