Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHARPINQ9H0F6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms