Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms