Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GFRA4Q9GZZ7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GFRA4Q9GZZ7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GFRA4Q9GZZ7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GFRA4Q9GZZ7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GFRA4Q9GZZ7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GFRA4Q9GZZ7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms