Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms