Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms