Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms