Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AMBRA1Q9C0C7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms