Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms