Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM6SF1Q9BZW5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms