Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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