Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms