Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SNHG12Q9BXW3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms