Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB1Q9BVT8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms