Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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