Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF1Q9BSM1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms