Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LARP6Q9BRS8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LARP6Q9BRS8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms