Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF8Q9BRL6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF8Q9BRL6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms