Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLF1Q9BQI6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms