Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBA1CQ9BQE3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms