Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms