Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPIN2AQ99865 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms