Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCA3Q99758 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms