Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms