Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms