Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMG1Q96Q15 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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