Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPNS2Q96L46 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
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