Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms