Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED3Q96IU2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
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