Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RNFT2Q96EX2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms