Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC10A4Q96EP9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms