Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM44Q96DX7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM44Q96DX7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms